Quelques logiciels à mon avis incontournables (presque tous pour Windows, désolé pour les Linuxiens et les Macintoshistes).

Voir aussi d'excellentes sélections de logiciels sur www.sebsauvage.net/logiciels, sur  www.loliwin.org, sur www.figer.com, sur  http://www.filehippo.com
Un site qui recense les logiciels gratuits en français.
Une compilation de logiciels utiles et gratuits (PC World, mars 2007).
Sites qui recensent les dernières versions de la plupart des logiciels utiles: http://finalbuilds.edskes.net - http://www.filehippo.com
Pour rechercher des logiciels correspondant à des critères, je vous conseille l'interface de recherche de download.com, et également  Framasoft.

Quand j'ai commencé le site, je pensais que le sommaire de ce que j'allais y mettre tiendrait sur cette page. Depuis, les choses ont beaucoup évolué. Je ne m'occupe plus vraiment de la légende décrite ci-après...
Légende: Freeware:  gratuit; Shareware:  payant après une période d'essai gratuite; Fr :  en français, En :  English; Win-Mac-Linux : pour Windows, Macintosh, Linux.
En principe, ce qui est écrit était exact à la date où cela a été écrit. Il peut y avoir de nombreuses omissions. Par exemple, En signifie qu'il existe une version du logiciel en anglais. Il peut très bien y en avoir aussi une en français.
Sommaire
Total Commander : gestionnaire de fichiers - Shareware, Fr-En, Win
http://www.ghisler.com/
Il s'agit d'un gestionnaire de fichiers bien plus puissant et agréable que l'Explorateur de Windows. Il sait quasiment tout faire, même si la doc manque un peu de clarté (à mon avis il s'agit du seul défaut). Mais l'auteur est accessible sur les forums de http://www.eforum.de/, et il répond rapidement aux questions.
Voici trois documentations "faites maison":
- doc des fonctions essentielles (rédigée par Nico) ici (ancienne version de la doc), ou sur les pages de Nico (pour la dernière version),
- mes paramètres de configuration au format html ou .doc,
- un petit guide pour la synchronisation via FTP avec des fichiers hébergés sur un serveur (de free.fr par exemple): version .doc ou version html.
Parmi les points forts:
- comparaison de fichiers et répertoires, fonctions de synchronisation de répertoires, comparaison de fichiers (en texte ou en binaire),
- possibilité de zipper et dézipper (pas besoin de Winzip),
- client FTP intégré,
- change les attributs de fichiers (date, heure, attributs r a h s),
- cherche les fichiers en double sur un disque,
- renomme un ensemble de fichiers avec des fonctions évoluées, 
- tronçonne (découpe) des fichiers en plusieurs morceaux, et les réassemble,
- gère les CRC au format SFV ou MD5,
- code / décode des fichiers selon divers protocoles (MIME, UUE, XXE, BinHex),
- pour les utilisateurs avancés, n'oubliez pas d'aller voir la page http://www.ghisler.com/addons.htm où vous trouverez plein d'extensions du programme,
- etc...
Voir aussi la description de www.sebsauvage.net/logiciels/totalcmd.html
Il s'agit d'un "shareware": après une période d'essai, et si vous comptez continuer à vous servir du logiciel, vous êtes moralement tenu de verser à l'auteur une contribution de 28 Euros (licence acquise "à vie", et vous pourrez indéfiniment le mettre ensuite à jour au fur et à mesure de l'évolution du logiciel). Vous pouvez toutefois continuer de l'utiliser indéfiniment (et sans limitation), au prix d'un clic supplémentaire à chaque démarrage du logiciel.
Il existe un clone en freeware www.freecommander.com, mais je ne l'ai pas essayé car je n'en vois pas l'intérêt (vu que j'ai acquis la licence de l'original bien avant que le clone n'existe).

IrfanView : afficher et modifier des images - Freeware, En, Win
Visionneuse d'images et photos, captures d'écran, conversion entre formats graphiques. Indispensable.
Voir une petite notice perso.
Associé à AFPL Ghostscript, il sait aussi travailler avec les fichiers postscript (PS, EPS) et les PDF. Voir plus de détails sur la page d'IrfanView.

Il existe aussi un convertisseur libre (ImageMagick) qui permet de convertir entre formats d'images et également de faire des animations (GIF animé, MPEG, MNG). Voir http://www.framasoft.net/article2777.html. Pas encore essayé.

X1, Yahoo Desktop Search, Copernic Desktop Search, Windows Desktop Search - En, Win
Pour rechercher vos informations égarées dans le mail, tous les fichiers de votre PC,etc...
Voir la page "Desktop Search".

Traqueur : éliminer les doublons - Freeware, Fr-En, Win
Un excellent logiciel gratuit pour trouver les fichiers en double. Suivre ce lien.
Avec Traqueur vous pouvez rechercher tous les fichiers en double, et ce par plusieurs options : recherche sur les fichiers portant le même nom, la même date, la même extension, le même contenu. De plus, il est possible de comparer deux répertoires pour obtenir les différences ou les similitudes.

Prise de contrôle d'un ordinateur à distance avec VNC (Freeware, En, Win-Mac-Linux), Messenger,...
Suivre ce lien.

Sauvegarder les positions des icônes du bureau - Freeware, Fr, Win
Si vous en avez marre de les remettre en ordre à chaque fois que vous changez de résolution, utilisez Icosauve de http://www.ptorris.c

Editeur de texte:  Freeware, En, Win
PSPad: http://www.pspad.com/fr et http://sebsauvage.net/logiciels/poweruser.html.

Notepad2 est aussi un excellent choix. Lire toutes ses fonctions intéressantes sur http://www.framasoft.net/article2917.html. Sans compter qu'il n'a même pas besoin d'être installé; et qu'il suffit de poser un fichier texte dedans pour savoir quel jeu de caractères il utilise (UTF-8, ANSI,...). Il est particulièrement performant sur les gros fichiers (il ouvre un fichier de 60Mo en un éclair, contrairement à PSPad).

Editeur html: Nvu / KompoZer et PSPad
Nvu était excellent comme éditeur html WYSIWYG. Mais il est rendu obsolète par KompoZer (voir plus bas) - Freeware, En-Fr, Win-Mac-Linux
http://www.framasoft.net/article2243.html
http://www.framasoft.org/article3200.html et son guide d'utilisation associé eu format PDF
http://www.nvu.com/
Problème entre Nvu et ZoneAlarm: voir ce lien.

KompoZer est la nouvelle mouture de Nvu. 
http://www.framasoft.net/article2243.html
http://www.kompozer.net/
La meilleure façon de débuter est de lire ce lien. On y trouve entre autres:
- Pourquoi choisir KompoZer plutôt que Nvu?
- Pour avoir KompoZer en français
- Conseils d'installation

PSPad (voir plus haut) est excellent comme éditeur html en mode texte (librairie Tidy intégrée pour formater et vérifier le code HTML, suppression des merdes rajoutées par Word; conversion en CSS, XML, XHTML; reformatage et compression du HTML; modification de la casse des tags,...).
Il y a un bug pénible: lorsque la page html est au format ISO-8859-1, la remise en forme du code html avec Tidy supprime le caractère euro (€ = $euro;) et le remplace par le caractère ¬ (il lui arrive aussi de bouffer les apostrophes!). Pour éviter cela, toujours utiliser UTF-8 (dans KompoZer : Format > Page title and properties > Character set > UTF-8).

En dépannage, vous pouvez écrire un email avec Thunderbird (qui vous donne pas mal de possibilités de formatage, y compris de tableaux), puis enregistrer le brouillon d'email sous le format html, sélectionner ce brouillon, puis dans le menu de Thunderbird: Affichage > Code source du message, et aller chercher dans le message le bout de code html convoité...

Une fois vos pages créées, il est utile de rechercher les liens morts (par exemple, ceux qui donnent la fameuse erreur "404 Not Found"). Pour cela je vous recommande Xenu's Link Sleuth.

Manipuler des fichiers audio
Audacity - Freeware, Fr, Win-Mac-Linux 
Très complet, gratuit, mais pas toujours intuitif...
http://audacity.sourceforge.net ou http://audacity.fr
Une notice pour nettoyer un enregistrement (ronronnement avec Notch Filter, craquements, souffle).
Enregistrement de n'importe quelle source du PC (direct, entree line, cd, micro...).

WavePad Sound Editor (Freeware) / Wavepad Master's Edition (Shareware) - En, Win-Mac
Indispensable! Un petit programme excellent et simple à utiliser (c'est pourquoi je le préfère à Audacity). Il permet d'ouvrir un fichier audio (divers formats), de le recouper, de triturer le son (normaliser les niveaux sonores avec "Automatic Gain Control" (ce que ne fait pas Audacity), remove noise or hiss = suppression des souffles, craquements), puis de le sauver dans un format de son choix parmi WAV, MP3, OGG, AIF, AIFF, AU, FLAC, AAC, M4A, GSM, VOX, RAW, RSS, M3U, PLS, WPL, AMR. Voir le site de l'éditeur. Différences entre la version gratuite et la version payante.

The GodFather - Freeware, Fr-En, Win
D'après PC Expert, mai 2007, p.45, ce serait le meilleur logiciel pour gérer sa bibliothèque audio; gestion des tags, des pochettes d'albums. Compatible avec tous les formats de fichiers (MP3, AAC, Ogg, APE, FLAC, MPC, APL, WV, MP4, OFR, SPX,...) sauf le WMA.
http://users.forthnet.gr/the/jtclipper/
L'utilisation n'est pas intuitive, mais après un effort d'apprentissage conséquent (!), je le préfère maintenant aux logiciels que j'utilisais auparavant: Musicmatch Jukebox (qui vient de devenir Yahoo! Music Jukebox) et iTune.

Winamp - Freeware, Fr-En, Win
Je continue à l'utiliser pour l'écoute des MP3, et aussi pour enregistrer automatiquement les stations qui émettent sur le web.
Pour exporter (copier) tous les fichiers d'une playlist vers un répertoire ou un support de votre choix, utilisez le plugin "copieur de liste". Une fois installé, il apparait dans les préférences. Pour l'utiliser, il faut faire un clic droit sur la barre du Playlist Editor (cadre jaune sur cette copie d'écran).

Convertir un fichier entre divers formats audio

Compass : gestionnaire de bookmarks (favoris) - Shareware, En, Win
Absolument génial, en particulier car il permet des recherches en texte intégral dans les favoris, d'y mettre des annotations (également indexées), d'exporter les favoris comme page html, etc...
Suivre ce lien.

Voir également la page des navigateurs.

Créer et manipuler des fichiers PDF: Adobe Acrobat, PDFCreator, eXPert PDF - Freeware, Fr-En, Win
Pour voir des fichiers PDF, il suffit de télécharger Adobe Acrobat Reader (gratuit) sur http://www.adobe.com/fr/ et de l'installer.

Pour créer gratuitement des fichiers PDF, je vous conseillais auparavant PDFCreator. Lire http://www.framasoft.net/article1572.html et un guide d'installation et de configuration. Une fois installé, vous aurez une nouvelle imprimante virtuelle. En imprimant sur cette imprimante n'importe quel document depuis n'importe quelle application, vous le transformez en fichier PDF.
Sans l'avoir essayé, je vous conseillerais plutôt maintenant eXPert PDF Pro, dont vous pouvez récupérer la version 5 gratuitement ici.

Vous pouvez également imprimer sur une imprimante postscript, puis transformer le fichier obtenu en PDF avec GSview. Voir ici.

Vous pouvez utiliser un convertisseur de documents en ligne (rien à installer dans ce cas).

Un récapitulatif des offres de conversion en PDF disponibles en ligne (mai 2007).

La suite bureautique OpenOffice (gratuite) permet de convertir tous les documents qu'elle sait ouvrir (beaucoup!) en fichiers PDF.
L'extension Sun PDF Import permet de modifier avec OpenOffice un PDF existant.Voir cet autre lien.

PDF Split and Merge: gratuit. Permet d'assembler ou de couper des fichiers. Pas essayé.

PDFVue : un outil gratuit en ligne pour créer ou modifier des PDF. Lien. Pas essayé.

AnyBizSoft PDF to Word Converter : voir ici. Convertit aussi les PDF cryptés. Pas essayé

DUmeter, NetMeter, WatchWAN: pour surveiller les débits en download & upload sur les interfaces réseau - Shareware, Fr-En, Win
Très utile si vous cherchez à comprendre ce qui se passe sur votre ordinateur en ce qui concerne les connexions réseau (que ce soit par cable ou Wi-Fi).
http://www.rosecitysoftware.com/dumeter/ : quelques copies d'écran
http://www.hageltech.com/dumeter/ : site de l'éditeur
http://www.dumeter.com/download.php?LangID=FR : pour la version française

Comme j'ai acheté DUmeter, je continue à l'utiliser pour l'amortir, mais il existe d'autres logiciels gratuits similaires:

Microsoft Antispyware, Ad-Aware, SpyBot, PestPatrol, HijackThis - Win
Pour se débarrasser des logiciels espions (spywares). Suive ce lien.

Virus
Il est évidemment indispensable d'avoir en permanence un antivirus à jour.
Pour un topo sur la question et le choix d'un anti-virus: http://assiste.com.free.fr ou http://dottech.org/headline/3174
Pour des analyses "en ligne" occasionnelles, voir ici ou bien ici.
Pour analyser d'un seul coup un fichier avec tous les antivirus du commerce: http://www.virustotal.com/  et des indications ici.

Un antivirus performant et gratuit: Avast, http://www.clubic.com/article-37030-10-comparatif-antivirus-2006.html , avec en prime un comparatif des logiciels disponibles en août 2006. Egalement meilleur choix de l'Ordinateur Individuel (No d'avril 2007). Je l'ai adopté depuis l'automne 2007, mais je l'ai remplacé par Antivir début 2009, car Avast me donnait trop de faux positifs (détection de soit disant virus dans des fichiers qui n'en contiennent manifestement pas).

Ne vous faites pas piéger en achetant Norton AntiVirus 2007: lors de l'installation, il m'a informé qu'il n'est pas compatible avec ZoneAlarm, et il préconise de supprimer ZA! Pourtant certaines anciennes versions de Norton AntiVirus fonctionnent très bien avec ZA. C'est probablement pour essayer de fourguer leur propre firewall. Raté, c'est NAV qui est passé à la trappe chez moi... Un point positif toutefois: on peut se le faire rembourser.

Juin 2007: comparatif d'antivirus (et autres anti-cochonneries) gratuits.
Mars 2008: comparatif d'antivirus: Antivir serait maintenant le meilleur des antivirus gratuits. C'est celui que j'utilise de préférence depuis début 2009. Son seul inconvénient est qu'il ouvre une fenêtre pop-up toutes les 24h pour inciter à l'achat de la version payante.
Mai 2008: comparatif Avast! Familiale 4.8, AVG 8 Free Edition, Antivir 8 Personal Edition. Conclusion: éviter Avast.
Oct. 2008: comparatif Clubic des antivirus 2008.
Déc. 2008: la suite gratuite Comodo Internet Security (antivirus + firewall) a l'air intéressante, au moins pour le firewall. Pour le moment il n'y a pas beaucoup de tests de l'antivirus, qui semble très récent. A suivre... Lien1.

Janvier 2010: lors d'une mise à jour, Outpost Firewall Pro a planté le système, s'est planté lui-même, a foutu la pagaille dans Antivir. Impossible de les refaire fonctionner l'un et l'autre. J'ai dégagé Antivir et Outpost Firewall Pro, pour les remplacer par Comodo Internet Security. Depuis, j'ai un peu l'impression que la machine rame. Coïncidence?

Février 2010: comparatif: Avira, Avast, AVG.

Cryptage et protection des données - Freeware, En, Win-Linux
Juillet 2006
Pour protéger vos données (pour se faire pirater ou dérober presque sans remords son ordinateur, sa clef USB, son disque externe,...).
J'ai utilisé Steganos Safe 8 (Coffre-Fort 8 en version française. Payant), et TrueCrypt (gratuit).

Je préfère de loin TrueCrypt: plus rapide à utiliser, plus de possibilités, fonctionne sous Windows et Linux, et gratuit en plus! Existe aussi en version portable (utilisable de manière autonome sur clef USB ou disque externe).
J'ai fait un tutoriel que l'on peut suivre à la lettre pour l'installation et les réglages de base.
http://www.framasoft.net/article3931.html
http://www.truecrypt.org/

Avril 2008: Steganos Safe One est gratuit. Je ne l'ai pas essayé (je reste fidèle à Truecrypt). Voici une notice: http://www.pcastuces.com/pratique/securite/safe_one/page1.htm

KeePass Password Safe permet de stocker des mots de passe et des informations diverses dans une base cryptée. Il est simple d'emploi, permet de stocker à la fois une URL et les logins et mots de passe associés, et un champ permet de rajouter des commentaires à chaque entrée. C'est moins performant que ma méthode associant TrueCrypt et Compass (qui permet en plus de stocker n'importe quels autres types de fichiers dans le volume crypté). Mais c'est plus simple à mettre en oeuvre, et entièrement gratuit. De plus, il existe une version de Keepass pour Windows Mobile. Quelques liens: une doc.

Il peut être également intéressant de stocker des fichiers cryptés en ligne. J'ai utilisé keepyousafe, mais le service a fermé. Nota: C'est crypté pendant les transferts sur le web et le stockage sur leurs serveurs. Mais si on rapatrie un des fichiers sur un PC hôte, le fichier décrypté va rester dans les répertoires temporaires.
Le plus sûr est d'avoir une clef USB avec un Truecrypt portable et les fichiers sur la clef.

Voir aussi cette liste: http://wiki.castlecops.com/Lists_of_freeware_encryption_software
Voir aussi plusieurs outils gratuits, intéressants, et dont certains peuvent être intégrés à TotalCommander: http://www.kryptel.com/products/free.php

En 08/2010, j'utilise encore et toujours TrueCrypt, en version standard et en version portable sur ma clef USB. Et, pour sa simplicité d'emploi, je fais utiliser KeePass Password Safe à mon entourage.

Applications portables - Freeware, En, Win
Ce sont des applications autonomes, qui fonctionnent sur un support amovible (clef USB, disque externe,...). C'est absolument GENIAL si vous vous déplacez.
Suivre ce lien.

Dernière mise à jour: mai 2010